您好,欢迎来到伟德官网地址-bv伟德体育app-betvlctor伟德app下载 - betvlctor伟德app下载伟德官网地址bv伟德体育app有限公司官网!      设为首页 | 加入收藏 | 联系我们

伟德官网地址-bv伟德体育app-betvlctor伟德app下载 - betvlctor伟德app下载伟德官网地址bv伟德体育app有限公司

伟德官网地址联系电话
关于伟德官网地址

技术服务

伟德官网地址视频

联系伟德官网地址

公司名称:伟德官网地址-bv伟德体育app-betvlctor伟德app下载 - betvlctor伟德app下载伟德官网地址bv伟德体育app有限公司

地址:betvlctor伟德app下载省长沙市天心区解放西路466号汇源大厦1805室

电话:0731-84321919

传真:0731-85160101

Q Q:372403785、3504420063

邮箱:jingkebio@163.com

测序方案
相关产品
相关服务
总RNA提取
核酸提取和纯化
基因表达谱芯片
提取并纯化mRNA
mRNA片段化
二代测序文库构建试剂盒
荧光定量PCR
反转录成为cDNA
构建Illumina SE文库
二代测序文库定量试剂盒
双荧光报告基因载体构建
上机测序

 

  生物信息学分析

  1 原始数据处理

  1.1 测序数据统计分析

  1.2 测序数据去杂统计分析

  1.3 将原始序列进行接头去除和质量剪切

  1.4 测序数据评估

  1.5 测序序列可能含有低质量的碱基,在basecalling时对测序结果进行质量控制,之后得到的数据可用于后续拼接分析

  2 Mapping至已有的参考图谱

  2.l 基因表达量统计:一个基因表达水平的直接体现就是其转录本的丰度情况,转录本丰度越高,则基因表达水平越高。在分析中,我们可以通过定位到基因组区域或基因外显子区的reads计数来估计基因的表达水平,因此需要将测序得到的reads与参考基因进行比对(mapping)。

  3 基因功能注释

  说明:通过比对,将得到的contig和singlets序列与 NCBI 的 数据库(NR库。) 进行比较,对提交比对的序列的进行功能注释,以列表的形式给出比对的结果。

  4 分析表达差异

  通过将reads比对到相应的unigene上,可以获得unigene在样本中的表达量情况。通过对不同样品的表达量进行计算,可以得出unigene在这些样品中是否存在表达差异。

 

 

  5 GO富集分析

  5.l GO分类:GO(Gene Ontology) 是基因本体论联合会建立的数据库,适用于各物种, 对基因和蛋白功能进行限定和描述。利用 GO 数据库,可以将基因按照它们参与的生物学过程、构成细胞的组分,实现的分子功能等进行分类。因此GO注释更加便于我们理解基因背后所代表的生物学意义。

  5.2 GO注释包括3大方面:

  Cellular component:the parts of a cell or its extracellular environment.

  Molecular function:the elemental activities of a gene product at the molecular level, such as binding or catalysis.

  Biological process:operations or sets of molecular events with a defined beginning and end, pertinent to the functioning of integrated living units: cells, tissues, organs, and organisms.

 

 

  5.3 GO差异比较:在同一个组织中,其功能表达在不同的条件下可能会有所变化。结合GO分析的结果,可以得知涉及各GO号的序列数目。再通过使用统计学方法,可以计算出那些功能在不同条件下有明显的表达差异。

  6  Pathway (代谢途径)分析

  KEGG 库(encyclopedia of genes and genomes 数据库)。 对功能基因进行代谢通路分析可以加深对物种的代谢能力和合成能力的了解,便于实际生产应用。基于国际公认的代谢网路数据库KEGG(http://www.genome.jp/kegg/),我们提供所分析基因组的基因可能参与所有可能的代谢通路。

 

  7  差异基因表达模式聚类(样本数大于2)

  将所有样品共有的差异基因进行模式聚类分析。

 

  样品要求:

  1.所需Total RNA的量均不少于20μg/文库,Total RNA可以保存在DEPC处理过的水中、75%的乙醇、异丙醇中,具体以什么方式保存请注明。

  2. 如提供实验材料为动物组织材料,样品质量需大于2g;

  3. 如提供实验材料为植物样品,样品质量需大于4g;

  4. 如提供实验材料为培养细胞,请提供1×107培养好的细胞;

  5. 如提供实验材料为血液样品,请提供≥2ml的样品。

  我们强烈建议在送样的同时客户做好备份,以备后续实验之用。

  样品纯度要求:

  1. OD260/OD280在1.8-2.0之间,RNA无降解、28S和18S核糖体RNA条带非常亮且清晰(其大小决定于用于抽提RNA的物种类型),28S的密度大约是18S的2倍;Agilent 2100检测仪分析RNA完整性数据RIN≥8。

  2. 无蛋白质、基因组DNA污染,如有污染请去蛋白并进行DNase I处理。

  请提供至少一种样品的凝胶电泳或者Agilent 2100检测仪检测图片,并注明其浓度、体积、OD260/OD280、溶剂名称、制备时间、物种来源以及特别备注。最终以我方定量、质检为准。

 

首页 | 关于伟德官网地址 | 产品中心 | 产品搜索 | 技术服务 | 合作伙伴 | 新闻资讯 | 联系伟德官网地址

伟德官网地址-bv伟德体育app-betvlctor伟德app下载

  • <tr id='bd8b8f'><strong id='bd8b8f'></strong><small id='bd8b8f'></small><button id='bd8b8f'></button><li id='bd8b8f'><noscript id='bd8b8f'><big id='bd8b8f'></big><dt id='bd8b8f'></dt></noscript></li></tr><ol id='bd8b8f'><option id='bd8b8f'><table id='bd8b8f'><blockquote id='bd8b8f'><tbody id='bd8b8f'></tbody></blockquote></table></option></ol><u id='bd8b8f'></u><kbd id='bd8b8f'><kbd id='bd8b8f'></kbd></kbd>

    <code id='bd8b8f'><strong id='bd8b8f'></strong></code>

    <fieldset id='bd8b8f'></fieldset>
          <span id='bd8b8f'></span>

              <ins id='bd8b8f'></ins>
              <acronym id='bd8b8f'><em id='bd8b8f'></em><td id='bd8b8f'><div id='bd8b8f'></div></td></acronym><address id='bd8b8f'><big id='bd8b8f'><big id='bd8b8f'></big><legend id='bd8b8f'></legend></big></address>

              <i id='bd8b8f'><div id='bd8b8f'><ins id='bd8b8f'></ins></div></i>
              <i id='bd8b8f'></i>
            1. <dl id='bd8b8f'></dl>
              1. <blockquote id='bd8b8f'><q id='bd8b8f'><noscript id='bd8b8f'></noscript><dt id='bd8b8f'></dt></q></blockquote><noframes id='bd8b8f'><i id='bd8b8f'></i>