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邮箱:jingkebio@163.com

服务编号

服务项目

相关产品

相关服务

STR01

SSR引物开发

核酸提取与纯化产品

DNA测序

STR02

SSR引物筛选

STR03

引物设计与合成

STR04

PCR条件优化

PCR/RT-PCR产品

STR05

PCR扩增

STR06

测序仪检测

载体构建

STR07

原始数据分析

一代测序仪相关产品

STR08

群体遗传学分析

STR09

AFLP检测

 

 

  服务项目:

  1.SSR引物开发

  通过富集微卫星序列,开发出20-30条具有一定重复特征的微卫星序列,并且对序列进行多态性和特异性验证。

  2.引物筛选

  选取部分代表性样本,利用普通引物进行PCR扩增,然后利用高分辨率芯片电泳或PAGE验证引物的特异性、扩增效率和基因座多态性等信息(图1)。

  图1 用岛津MultiNA芯片电泳仪进行引物筛选的结果

 

  3.样本批量扩增

  用带有荧光标记(FAM/HEX/TMR/ROX等)的引物,对批量样本进行PCR扩增。我公司拥有高通量PCR仪平台,可以满足大量样本扩增需求。

  4.测序仪检测

  带有荧光标记的PCR产物进行稀释后与分子量内标混合,用3730xl等测序仪进行毛细管电泳,并得到原始数据(fsa文件,见图2)。

  图2 应用3730xl测序仪检测得到的原始图谱

 

  5.原始数据分析

  编制panel和bin等文件,使用正版GeneMapper v4.0软件分析测序仪得到的fsa文件,并生成PDF图谱和Excel文档(包括size、基因分型等信息),分析后的电泳图谱见图3。

  图3 GeneMapper软件分析后的电泳图谱

 

  6.群体遗传学分析

  利用生物信息学软件(POPGENE、MEGA、PHYLIP、ARLEQUIN等)对上述数据进行进一步分析,绘制遗传连锁图谱、分析连锁不平衡和分析多态性等。

  送样要求:

  细胞(≥106 )、组织(≥300mg)、血液(≥1ml)、基因组DNA(≥20μl,浓度≥ 50ng/μl);引物信息、片段长度范围、琼脂糖电泳图等。

  提供结果:

  引物、微卫星分析的原始数据以及GeneMapper生成的PDF图谱、包含片段长度等信息的Excel文档和进一步的分析结果等。

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